Вроде проблему решила. Надо было каждый снимок кадрировать с сохранением центрального наиболее четкого участка, прежде чем загружать в Autopano
Я кадрирую все снимки сразу в Adobe Camera Raw.
Вот моя последняя фотография, прошедшая проверку экспертов
http://www.shutterstock.com/pic-4421896 ... ef=2863621 Если это еще кому-то нужно, как-нибудь опишу подробно весь процесс сшивки